補助金申請代行の厳選12選！メリットと選び方を徹底解説
昨今、多くの企業が事業拡大や新しい取り組みのために補助金の活用を検討しています。
しかし、その申請プロセスは複雑で、専門知識や多くの時間が必要となります。
この記事では、そんな事業主の悩みを解決する「補助金申請代行」について、そのメリットやデメリット、選び方を徹底解説します。
さらに、数ある代行サービスの中から厳選した12社を目的別に紹介します。
この記事を読めば、あなたの事業に最適なサービスが見つかるでしょう。
補助金申請代行とは？そのサービス内容と仕組みを徹底解説
補助金申請代行のサービス概要
補助金申請代行とは、企業や個人事業主に代わって、補助金の申請手続きをサポートするサービスです。
このサービスは、主に中小企業診断士や行政書士といった専門家が行います。
具体的な業務内容として、申請書類の作成、事業計画書の策定支援、事務局とのやり取りなど、申請に必要な手続きを包括的にサポートします。
これにより、事業主は本業に集中できるというメリットがあります。
補助金申請代行とコンサルティングの違い
補助金申請代行は、主に書類作成や手続きといった事務作業の代行に重点を置いています。
一方、コンサルティングは、申請内容のブラッシュアップや事業計画の立案など、より戦略的な側面から申請をサポートする点が特徴です。
「代行」と「コンサルティング」のニュアンスの違いを明確に理解できるとわかりやすいのではないでしょうか。
補助金申請を代行に依頼する３つのメリット
専門家の力で採択率をアップできる
代行業者に依頼することで、補助金ごとの審査ポイントや採択されやすい事業計画のノウハウを活用できるため、自社で申請するよりも採択率が上がる可能性が高くなります。
プロによる添削やアドバイスが、質の高い申請書に繋がるのです。
申請にかかる時間と労力を大幅に削減できる
補助金申請は、事業計画の策定や必要書類の収集など、多大な時間と労力を要します。
代行サービスを利用することで、事業主はこれらの作業から解放され、本業に集中できます。
具体的には、資料作成、情報収集、申請手続きなどの業務をプロに任せることが可能です。
最新の補助金情報や制度をキャッチできる
補助金制度は頻繁に内容が変更されたり、新しい制度が追加されたりします。
代行業者は常に最新情報を把握しているため、自社では見逃しがちな最適な補助金制度を見つけられるというメリットがあります。
また、2025年度からは省力化投資補助金や中堅・中小企業成長投資補助金など、新しい制度も次々と導入されており、専門家のサポートがより重要になっています。
補助金申請代行を依頼する際の注意点・デメリット
費用が発生する
代行サービスを利用するには、着手金や成功報酬などの費用が発生します。
費用の相場は、着手金が数万円～、成功報酬は採択額の10%～20%程度となっており、事前に見積もりを取ることが重要です。
業者選びを間違えると失敗につながるリスク
業者選びを間違えると失敗につながるリスクがあります。
すべての代行業者が優良とは限りません。
過去の実績や料金体系を確認せずに依頼すると、十分なサポートが受けられなかったり、追加費用が発生したりすることがあります。
無資格者が補助金申請書類を作成・提出する行為は違法
特に注意が必要なのが、補助金申請書類の作成代行です。
行政書士法（第1条の2）では「他人の依頼を受け、報酬を得て、官公署に提出する書類を作成すること」は行政書士などの有資格者のみが行える業務と定められています。
そのため、無資格者が報酬を得て補助金申請書類を作成・提出する行為は違法となります。
経済産業省も2026年からこの点を明確化する方針を示しており、トラブル防止のため法整備が進められています。
実際、申請書の内容を理解しないまま代行に任せた結果、不採択や交付取消となるケースも報告されています。
補助金サポートを依頼する際は、行政書士や中小企業診断士などの有資格者、または「アドバイス・相談支援」にとどまる専門家を選ぶことが重要です。
失敗しない補助金申請代行会社の選び方３つのポイント
支援実績が豊富で、専門分野に強みがあるか
過去の採択実績や、自社の事業分野（IT、製造業、サービス業など）の補助金に強いかを確認することが重要です。
実績が豊富な業者は、審査のポイントを熟知している可能性が高いといえます。
料金体系が明確で、追加費用がないか
「着手金無料」「成功報酬型」など、業者によって料金体系が異なります。
契約前に、見積書でサービス内容と費用の内訳を詳細に確認し、後から不透明な追加費用が発生しないか確認することが重要です。
担当者との相性やコミュニケーションが円滑か
補助金申請は長期にわたるプロジェクトになるため、担当者との相性が重要です。
初回相談の際に、質問に丁寧に答えてくれるか、こちらの意図を汲み取ってくれるかなど、担当者の対応をよく確認することをおすすめします。
目的別！補助金申請代行厳選12選
1. SMC税理士法人
経済産業省認定の経営革新等支援機関として、補助金申請代行に豊富な実績を持つ税理士法人です。
特にものづくり補助金において高い実績を誇ります。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 経済産業省認定の経営革新等支援機関として信頼性が高い。税理士法人ならではの財務面も含めた総合的なサポート体制 |
| 特徴（３つのポイント） | ①ものづくり補助金の高実績 ②経営革新等支援機関としての信頼性 ③税理士法人による総合的な財務サポート |
| 代行業務内容 | ものづくり補助金申請、事業再構築補助金申請、事業計画書作成、財務相談 |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 税理士法に基づく守秘義務、経営革新等支援機関認定 |
| 実績 | 認定支援機関としての豊富な支援実績 |
| 所在地 | 東京都中央区八丁堀2-8-2 八丁堀共同ビル 502 |
| URL | https://www.smc-g.co.jp/ |
2. Guidy株式会社
成長企業向けに特化した補助金申請支援サービスを提供。
認定経営革新等支援機関として、累計300社以上の補助金採択を支援した豊富な実績を持つ専門コンサルティング会社です。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | スタートアップや成長企業に特化した補助金申請支援。革新的なビジネスに強く、申請書のクオリティとスピードを両立 |
| 特徴（３つのポイント） | ①累計300社以上の採択支援実績 ②初期費用0円・採択時のみ費用発生 ③ヒアリングから採択後の入金支援まで一貫サポート |
| 代行業務内容 | 事業計画書作成、申請書類作成、審査員への対応、採択後フォロー、入金支援 |
| 料金体系 | 月額報酬制（5万円〜） |
| 料金 | プレミアム月額15万円 アドバンス月額8万円 ベーシック月額5万円 |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 東京都品川区西五反田2-14-13 ニックハイム五反田2F |
| URL | https://guidy.co.jp/ |
3. 株式会社ライトアップ（JSaaS）
東証グロース市場上場企業が提供する補助金・助成金支援サービス。
全国47都道府県に対応し、累計1万件以上の支援実績を誇る大手サービスプロバイダーです。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 上場企業が運営する信頼性の高いサービス。幅広い補助金・助成金に対応し、月額固定+成功報酬の明確な料金体系 |
| 特徴（３つのポイント） | ①累計支援実績１万件超 ②月額固定報酬3,000円+成功報酬３%程度の低コスト ③全国47都道府県対応可能 |
| 代行業務内容 | 補助金・助成金の提案、申請書類作成支援、審査対応、採択後サポート |
| 料金体系 | 固定+成果報酬 |
| 料金 | 月額3,000円+成功報酬3%程度（初期費用なし） |
| セキュリティ | 上場企業基準のセキュリティ体制 |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 東京都渋谷区渋谷2-15-1 渋谷クロスタワー32F |
| URL | https://www.writeup.jp/ |
4. 株式会社アクセルパートナーズ
事業再構築補助金をはじめとする大型補助金の申請支援に強みを持つコンサルティング会社です。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 事業再構築補助金に特化した申請支援を行う専門コンサルティング会社 |
| 特徴（３つのポイント） | ①事業再構築補助金での豊富な採択実績 ②大型補助金に対応可能 ③戦略的な事業計画策定支援 |
| 代行業務内容 | 事業再構築補助金申請、事業計画書作成、財務計画策定 |
| 料金体系 | 成果報酬 |
| 料金 | 成功報酬 採択金額の10%(下限100万円) |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 東京都品川区東五反田4丁目9-2東五反田KBビル12F |
| URL | https://listing-partners.com/gbiz/ |
5. 株式会社トライズコンサルティング
ものづくり補助金を中心に製造業の補助金申請支援に特化したサービスを提供しています。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 製造業に特化した補助金申請支援を行うコンサルティング会社 |
| 特徴（３つのポイント） | ①ものづくり補助金での高い採択率 ②製造業特有の技術的理解 ③設備投資計画の専門的サポート |
| 代行業務内容 | ものづくり補助金申請、技術開発計画書作成、設備投資計画策定 |
| 料金体系 | 着手金+成功報酬 |
| 料金 | 着手金：16万5000円 成果報酬：補助金額の12％(最低報酬額70万円) |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 千葉県千葉市中央区弁天１丁目１５−３ リードシー 千葉駅前ビル B1F |
| URL | https://trise-c.jp/ |
6. HTMコンサルティンググループ株式会社
中小企業の経営コンサルティングと補助金申請支援を一体化したサービス。
経済産業省認定の経営革新等支援機関として、豊富な実績を持ちます。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 経営コンサルティングと補助金申請支援の一体化サービス。経済産業省認定の経営革新等支援機関 |
| 特徴（３つのポイント） | ①ものづくり補助金採択率90.1%の高い実績 ②経営コンサルティングとの連携サポート ③中小企業の経営課題解決に特化 |
| 代行業務内容 | ものづくり補助金申請、事業再構築補助金申請、経営コンサルティング |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 支援件数は1,000社以上 採択実績90％以上 |
| 所在地 | 東京都墨田区錦糸2-14-3 錦糸町第六秦ビル4階 |
| URL | https://htm-consul.com/ |
7. 株式会社WEEVA
IT系スタートアップ企業向けの補助金申請支援に特化したサービスを提供しています。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 補助金・助成金の申請支援を行うコンサルティング会社。最適な制度の選定支援、事業計画書・申請書類の作成支援、提出までのサポート等を提供している。 |
| 特徴（３つのポイント） | ①IT系企業の事業理解の深さ ②スタートアップ特有の課題への対応 ③技術開発系補助金への精通 |
| 代行業務内容 | 研究開発補助金申請、事業化支援、技術開発計画策定 |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 東京都新宿区西新宿3丁目6−4 Circles西新宿 5階 |
| URL | https://weeva.co.jp/ |
8. 株式会社G&N
幅広い業種に対応した総合的な補助金申請支援サービスを展開している専門会社です。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 業種を問わず幅広い補助金申請に対応する総合コンサルティング会社 |
| 特徴（３つのポイント） | ①多様な補助金制度への対応力 ②業種特化型の専門チーム体制 ③申請から実行まで一貫サポート |
| 代行業務内容 | 各種補助金申請、事業計画書作成、実績報告書作成 |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 700社以上支援 |
| 所在地 | 東京都中央区東日本橋3-4-18 東日本橋EXビル5階 |
| URL | https://gandn.co.jp/ |
9. 税理士エージェンシー（株式会社サウスエージェンシー）
税理士との連携により、財務面も含めた総合的な補助金申請支援を提供しています。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 税理士との連携による財務・税務を含めた補助金申請支援サービス |
| 特徴（３つのポイント） | ①税理士との連携による財務面サポート ②税務処理を含めた一貫サポート ③資金調達全般への対応 |
| 代行業務内容 | 補助金申請、財務計画作成、税務相談、資金調達支援 |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 税理士法に基づく守秘義務 |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 東京都目黒区青葉台4-4-12 THE N3 504 |
| URL | https://www.southagency.co.jp/ |
10. 株式会社High Adoption
採択率向上に特化した独自のメソッドを持つ補助金申請支援の専門会社です。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 独自の採択率向上メソッドを開発した補助金申請支援の専門会社 |
| 特徴（３つのポイント） | ①申請～入金までの一貫サポート ②データ分析に基づく申請戦略 ③継続的な改善とフォロー体制 |
| 代行業務内容 | 各種補助金申請、戦略策定、データ分析、継続サポート |
| 料金体系 | 要問合せ |
| 料金 | 要問合せ |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 独自メソッドによる採択率96% |
| 所在地 | 東京都港区赤坂8-8-7 アルボレスビル3F |
| URL | https://www.high-adoption.co.jp/ |
11. 株式会社アドベンチャーワン
中小企業の経営課題解決を目的とした、補助金・助成金申請の専門コンサルティングサービスです。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 中小企業の経営課題解決に特化した補助金・助成金申請専門コンサルティング |
| 特徴（３つのポイント） | ①経営課題の根本解決アプローチ ②補助金活用による成長支援 ③長期的なパートナーシップ |
| 代行業務内容 | 経営診断、補助金申請、成長戦略策定、実行支援 |
| 料金体系 | 固定・成果報酬 |
| 料金 | 料金モデル 着手金 22万円 ↓ 毎月先着10社まで 着手金 税込み11万円 |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 要問合せ |
| 所在地 | 福岡県福岡市中央区舞鶴1-8-39-3F |
| URL | https://ad-one.info/ |
12. Taigen株式会社
地方企業の補助金申請支援に特化し、地域密着型のサービスを提供している専門会社です。
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 特徴・全体説明 | 地方企業に特化した補助金申請支援と地域活性化支援を行う専門会社 |
| 特徴（３つのポイント） | ①地方企業の事情に精通 ②地域特有の補助金制度への対応 ③地域密着型のきめ細かいサポート |
| 代行業務内容 | 地域活性化補助金申請、地方創生支援、事業承継支援 |
| 料金体系 | 固定・成果報酬 |
| 料金 | 着手金10万円（税抜）＋成功報酬15%（税抜） |
| セキュリティ | 要問合せ |
| 実績 | 採択率90%以上 |
| 所在地 | 東京都荒川区東日暮里6-59-6-202 |
| URL | https://tai-gen.com/ |
補助金申請代行の導入事例・成功事例
事例1：製造業A社（従業員40名）- ものづくり補助金採択
フローリング製造業を営むA社は、生産性向上と労働環境改善を目的として、ものづくり補助金の申請を代行業者に依頼しました。
自動化設備の導入により生産効率が30%向上し、従業員の労働環境も大幅に改善されました。
代行業者のサポートにより、技術的な仕様書作成から事業計画の策定まで専門的な支援を受け、無事に採択を獲得できました。
事例2：IT企業B社（従業員15名）- IT導入補助金採択
新規事業の立ち上げを行うIT企業B社は、一人で全ての業務を行う必要があり、事業スピード上の問題を抱えていました。
代行業者の支援により業務効率化システムを導入し、新規事業を軌道に乗せることに成功しました。
特に、申請書類の作成やシステム仕様の整理を代行してもらったことで、本来の事業開発に集中できたことが成功の要因でした。
事例3：サービス業C社（従業員25名）- 事業再構築補助金採択
コロナ禍で既存事業に影響を受けたサービス業C社は、新たな事業分野への進出を決意。
代行業者のサポートにより事業再構築補助金を活用し、デジタル化を進めて新しいビジネスモデルを確立しました。
特に、新規事業の収益性を示す事業計画書の作成において、代行業者の専門知識が大きく役立ちました。
事例4：食品業D社（従業員60名）- 小規模事業者持続化補助金採択
地域密着の食品加工業を営むD社は、販路拡大とブランド力向上を目的として小規模事業者持続化補助金に申請。
代行業者のサポートにより、ECサイト構築と販促活動を実施し、売上を20%向上させることに成功しました。
特に、市場分析や競合調査といった専門的な部分を代行業者に任せられたことが大きなメリットでした。
最適なパートナー選びで補助金採択率を高めよう
補助金申請代行サービスは、専門家の力を借りて事業の成長を加速させる強力なツールです。
この記事で紹介したポイントを参考に、自社の目的や状況に合った最適なパートナーを見つけてください。
申請代行サービスを選ぶ際は、実績、料金体系、専門分野、担当者との相性を総合的に判断することが重要です。
また、自社のリソースや予算に応じて、フルサポート型か事務作業代行型かを選択することで、より適切なサービスを選ぶことができるでしょう。
※重要な注意事項：2026年1月からの行政書士法改正により、補助金申請書類の作成代行は行政書士の独占業務となります。サービス選定の際は、行政書士資格の有無や法的な適合性を必ず確認してください。
